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Septembre 2003, île de Florès, en Indonésie. Dans les grottes calcaires de Liang Bua, une équipe dirigée par Mike Morwood découvre les squelettes de sept individus. Les chercheurs surnomment "hobbits" ces mystérieux "hommes de Florès" (Homo floresiensis) qui s'apparentent en même temps à l'australopithèque et à Homo sapiens. Leur existence peut-elle remettre en cause les certitudes des paléontologues sur l'origine de l'homme, qui, selon eux, serait apparu en Afrique ?

L'hypothèse soulève une violente polémique qui continue de faire rage aujourd'hui. Quatre ans après, le Pr Morwood et son équipe retournent sur l'île en quête de nouveaux ossements, afin de relever s'ils le peuvent l'ADN d'un Homo floresiensis. Pour porter la tension à son comble, une équipe concurrente les talonne, avec les mêmes objectifs...